1. rész: Az első áldozat

Bones igyekszik elérni, hogy Booth-t kiengedjék a börtönből. Eközben az összeesküvés irányítója folyamatosan keresztbe tesz a csapatnak, úgy tűnik, a keze mindenhová elér, s Bonesék elveszítik egyik társukat is.

2. rész: Összeesküvés

Az összeesküvés szálai a régmúlt hooveri időkbe vezetnek, s úgy tűnik, olyan bűnözőt kell keresnie Booth-éknak, aki az FBI egykori létrehozójának és első vezetőjének szinte vallásos követője és csodálója.

3. rész: Mindenki gyanús

A népszerű, de radikális jobboldali rádiós műsorvezető halála számtalan kérdést vet fel, indítéka szinte mindenkinek lett volna a gyilkosságra. Booth, Aubrey és Bones dolgát nehezíti, hogy az áldozat megtalálásának helye és a gyilkosság helyszíne közti kapcsolat nem egyértelmű.

4. rész: Halálos játék

A Potomac folyó partra vet egy holttestet, amelynek hiányoznak a karjai. A jelek bosszúból elkövetett emberölésre utalnak, s egy sikeres játékszoftver-gyártó céghez vezetnek.

5. rész: A hóhért akasztják

Dr. Brennan a Törvényszéki Tudományok Konferenciáján készül előadni, ahol azonban megölnek és felgyújtanak egy fiatal nőt. A csapatnak számos feltörekvő tudós és újonnan szabadalmaztatott helyszínelő eszköz áll segítségére, hogy mielőbb megtalálja a gyilkost. Azonban pont ez lehet a nehézség is az ügyben, hiszen a tettes valószínűleg maga is tudós lévén tisztában van a törvényszéki vizsgálati módszerekkel, ezért sok a direkt, félrevezető nyom.

6. rész: Szerelem mindhalálig

Egyetlen késszúrással meggyilkolt nő holttestére bukkannak. Bones és csapata nyomoz az ügyben. Hamarosan kiderül, hogy a nő Kínából érkezett menekült. A szálak a munkaadójához vezetnek, akiről később kiderül, hogy korántsem az a jó szándékú úriember, akinek kiadja magát. A szerencsétlen sorsú fiatal nő sorsa mély nyomot hagy a csapatban. Bones közben visszadobja Vaziri disszertációs témaválasztását, ami tovább fokozza a feszült hangulatot.

7. rész: Az aranyifjú

Csúnyán roncsolódott, fiatal férfi holttestére bukkannak egy körhinta alatt. Hamarosan kiderül róla, hogy egy jól jövedelmező brókercégnél volt kereskedő, és mellette élte a gazdag nagymenők életét, kábítószerezett, csalta a feleségét. Az életszínvonala és az illegális üzletei miatt igen sok embernek állt érdekében megölni. Bones dolgát nehezíti a laborban felbukkant ambiciózus Wells, aki a helyére pályázik. Kiderül pár érdekes dolog a cinikus Aubrey múltjáról is.

8. rész: Az utolsó rejtvény

Savval leöntött hullát találnak egy gáztelepen. Hamar kiderül, hogy a híres rejtvényírót, Lawrence Brookst gyilkolták meg, azt azonban senki nem tudta, hogy Alzheimer-kórban szenvedett, és hogy megrögzött szerencsejátékos volt. Ez több kérdéssel és még több lehetséges ellenséggel gazdagítja a nyomozás menetét. Daisy látszólag kiheverte Sweets halálát, és visszatér dolgozni, de csak látszólag.

9. rész: Az ördög a részletekben rejlik

Egy neves pszichológia professzor levágott kezét találják egy kukában. Ahogy egyre több testrésze kerül elő a város különböző szeméttelepeiről, arra is fény derül, hogy a professzor a tanítványain folytatott kísérletet, és tudtuk nélkül manipulálta őket. Mivel néhányukkal viszonya is volt, nehéz eldönteni, kinek volt a legtöbb indítéka megölni. A nyomozást ezúttal Aubrey vezényli, és éles eszével kivívja Bones elismerését.

10. rész: Retró mese

A mai epizód különleges, jubileumi adás. Az 50-es években egy gyilkosság nyomán kialakult a törvényszéki antropológia, mint tudományág. Booth és Bones, no meg a csapat a főszereplők, bár mindenki egy kicsit más szerepben látható. A hangulat és a látvány Hitchcock-i, a történet lebilincselő, a sorozat kedvelőinek igazi csemege ez a rész.

11. rész: Médium a levesben

A fiatal Justine holttestére bukkannak egy fa belsejében, aki népszerű médium volt. Hamarosan kiderül róla, hogy valójában csak pénzt akart kicsalni az ügyfeleitől, így többeknek volt indítéka megölni őt. A nyomozást ezúttal Avalon segíti, akinek a szavaiban még mindig kételkedik a csapat. A munkára árnyékot vet, hogy aznap lenne Sweets születésnapja, illetve, hogy Fuentesről kiderül, hogy gyógyszereket csempész Kubába.

12. rész: A könyvesbolt rejtély

Egy hátrányos helyzetű diákokkal foglalkozó tanárnő holttestére bukkannak egy könyvesboltban. Bár a környék, ahol az iskola van, veszélyes, és a diákok sem mintadiákok, kiderül, hogy Mia csak értük élt, és mindent megtett, hogy segítse őket az életben. De akkor mégis kinek állhatott útjában?

13. rész: Süti, nem süti

Egy nemrég szabadult, jó útra tért fegyenc holttestére bukkannak, aki egy rehabilitációt szolgáló pékségben dolgozott. Hamarosan kiderül, hogy a látszat ellenére Connor Freeman mégsem az a csendes, szorgos munkatárs volt, akinek mutatta magát. Maradványaiban nagy mennyiségű drogot találnak, és fény derül arra is, hogy egy pénzváltó kirablását tervezte.

14. rész: A golfkirály

Egy tehetséges minigolf-játékos hullájára bukkannak. Troy Carter az őt futtató golfpálya-tulajdonos legnagyobb reménysége, akinek sok riválisa van, és aki titokban egy fiatalkorúval folytat szerelmi viszonyt. Sokaknak állhatott szándékában megölni őt, és a sérülései alapján egyszerre többen lőttek rá.

15. rész: Az őrszem

Egy profi pókerjátékos holtteste kerül elő egy ipari aprítógépből. Bár nehéz megkülönböztetni a gép okozta sérüléseket a halált okozó sérülésektől, Bonesék mégis megállapítják, hogy az áldozatot agyonverték. Innen már csak egy ugrás az indíték, ami egy hatalmas összegű nyeremény. Booth beépül a játékosok közé, hogy kiderítse, ki a gyilkos, ami leginkább függősége miatt veszélyes.

16. rész: Marhanagy marha

Chili Reuben, a híres gyorsétterem-kritikus és showman holttestére bukkannak. Aubrey nagy bánatára kiderül, hogy kedvenc sztárja mégsem volt olyan vagány mókamester, mint amilyennek hitte.A csapat kedvenc éttermének tulajdonosa is gyanúba keveredik. Hodgins találmányát hirtelen 40 millió dollárra értékelik, Saroyan hírt kap Vaziriről, Booth pedig tovább lépdel a tiltott úton.

17. rész: Elhagyatva

A 16 éves Molly Delson összeszurkált holttestére bukkannak az erdőben. Okos, céltudatos, de magányos lány volt, az osztálytársai örök céltáblája. Bones régi önmagát ismeri fel az áldozatban, ezért különös szorgalommal veti bele magát a nyomozásba, ami során érdekes felfedezést tesz saját érzéseivel és világlátásával kapcsolatban. Közben Daisyt randizni hívja a jóképű Jake, ami vegyes érzéseket vált ki belőle.

18. rész: Ítélet

Alex Rockwellt, a sorozatgyilkost Bones és Booth közös munkája nyomán ítélték halálra fél éve. A kivégzés előtt Bones még egyszer átnézi az aktát, és rájön, hogy ez egyszer tévedett, és mégsem Rockwell lehet a tettes. Míg ők versenyt futnak az idővel és a törvényhozással, a valódi gyilkos újabb áldozatot szed.

19. rész: Gyilkosság a Közel-Keleten

Saroyan fültanúja lesz, amint Vazirit elrabolják Iránban, ezért úgy dönt, hogy Booth kíséretében utána megy. Ott kiderül, hogy Arastoot egy befolyásos ember raboltatta el, hogy segítsen megoldani a fia halálának rejtélyét. A dolog nem veszélytelen, ugyanis ha nem sikerül, lecsukatja a csapatot. Közben Booth bukmékere felkeresi Bonest, ami súlyos következményekkel jár.

20. rész: Nő az örvényben

Booth csoportterápiára kényszerül, miután a játékszenvedélyével veszélybe sodorta a családját. Bones úgy érzi képtelen megbocsátani, ám új ügyük kapcsán megértőbbé válik. Ugyanis egy középkorú, furcsa gyűjtőszenvedéllyel rendelkező nő holttestére bukkannak a folyóban. Leslie süteményes csuprokat gyűjtött megszállottan, háttérbe szorítva ezzel mindent és mindenki mást az életében.

21. rész: Éltető tűz

Egy exfegyenc csúnyán összeégett holttestére bukkannak egy erdőtüzet követően. A jó útra tért bűnözőről kiderül, hogy népszerű jógaoktató volt, és senkinek nem állt szándékában megölni. A bizonyítékok is félrevezetők, olyannyira, hogy még Brennan is kénytelen a megérzéseire hagyatkozni. A nyomozás során ő és Booth újra közel kerülnek egymáshoz, míg Angela és Hodgins végleg eldöntik, hogy Párizsba költöznek.

22. rész: Végső megoldás

Megnyúzott férfi karóba húzott holttestére bukkannak, akivel pont ugyanúgy végeztek, ahogy Pelant ölte meg az áldozatait. Mivel ő halott, másoló gyilkosra gyanakszanak. A szálak ahhoz a céghez vezetnek, ahol vélhetőleg Pelant tartotta a Hodginstól ellopott pénzt. Az indíték, a rengeteg pénz, számos gyanúsítottat sodor a csapat útjába, akiknek ez az utolsó közös ügyük, hiszen Brennanék is bejelentik, hogy másik városba költöznek, és új életet kezdenek.